Sekolah Khusus Autis Bina Anggita Yogyakarta dengan semboyan "berbagi dan melayani dengan empati" mengutamakan mutu dan kualitas dalam memberikan layanan bimbingan pada peserta didik. Didukung dengan tenaga guru yang professional yang telah dibekali dengan pendidikan dan pelatihan penanganan anak autis secara holistic. Didukung konsultan medis oleh dr. Dandung Bawono dari RS. Dr. Sarjito Yogyakarta dan kerjasama dengan Pusat Pengamatan dan Penkajian Tumbuh Kembang Anak (P3TKA) Yogyakarta.

Beberapa prestasi siswa Bina Anggita banyak yang mengikuti pendidikan inklusif di sekolah regular baik di TK regular, SD Umum, SMP Umum. Dalam beberapa even perlombaan banyak memperoleh prestasi seperti bidang Matematika, Sains, Seni Lukis, Menari, Olahraga renang, Musik , dan lain-lain.